Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms