Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn6Q99PL6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms