Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms