Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms