Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms