Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vipas39Q8BGQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Vipas39Q8BGQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Vipas39Q8BGQ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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