Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6P435 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6P435 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6P435 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6P435 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6P435 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6P435 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6P435 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6P435 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6P435 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms