Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SrmQ64674 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms