Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms