Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JupQ02257 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JupQ02257 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JupQ02257 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JupQ02257 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JupQ02257 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JupQ02257 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
JupQ02257 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
JupQ02257 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JupQ02257 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms