Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl5P47962 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms