Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg3P47867 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg3P47867 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg3P47867 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg3P47867 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg3P47867 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms