Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab5cP35278 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab5cP35278 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab5cP35278 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5cP35278 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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