Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PcnaP17918 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PcnaP17918 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PcnaP17918 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms