Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms