Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX7O95931 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX7O95931 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX7O95931 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX7O95931 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBX7O95931 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms