Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms