Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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