Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Defa35E9QLQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa35E9QLQ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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