Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Epb41l1Q9Z2H5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epb41l1Q9Z2H5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epb41l1Q9Z2H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Epb41l1Q9Z2H5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Epb41l1Q9Z2H5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l1Q9Z2H5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l1Q9Z2H5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l1Q9Z2H5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Epb41l1Q9Z2H5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l1Q9Z2H5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l1Q9Z2H5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l1Q9Z2H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l1Q9Z2H5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms