Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Mbd3Q9Z2D8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mbd3Q9Z2D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Mbd3Q9Z2D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mbd3Q9Z2D8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mbd3Q9Z2D8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mbd3Q9Z2D8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Mbd3Q9Z2D8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Mbd3Q9Z2D8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms