Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms