Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J1

Tcf7l1, Transcription factor 7-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7l1Q9Z1J1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf7l1Q9Z1J1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf7l1Q9Z1J1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms