Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb6Q9Z0T9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb6Q9Z0T9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb6Q9Z0T9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb6Q9Z0T9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb6Q9Z0T9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb6Q9Z0T9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms