Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pmfbp1Q9WVQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pmfbp1Q9WVQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pmfbp1Q9WVQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms