Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cyp46a1Q9WVK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cyp46a1Q9WVK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cyp46a1Q9WVK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp46a1Q9WVK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cyp46a1Q9WVK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cyp46a1Q9WVK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cyp46a1Q9WVK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cyp46a1Q9WVK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cyp46a1Q9WVK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cyp46a1Q9WVK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cyp46a1Q9WVK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cyp46a1Q9WVK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cyp46a1Q9WVK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cyp46a1Q9WVK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cyp46a1Q9WVK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.8 ms