Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme4Q9WV84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme4Q9WV84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nme4Q9WV84 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme4Q9WV84 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme4Q9WV84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme4Q9WV84 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme4Q9WV84 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme4Q9WV84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme4Q9WV84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme4Q9WV84 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme4Q9WV84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.1 ms