Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stub1Q9WUD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stub1Q9WUD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stub1Q9WUD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stub1Q9WUD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stub1Q9WUD1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms