Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp18Q9WTV6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp18Q9WTV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp18Q9WTV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp18Q9WTV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp18Q9WTV6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp18Q9WTV6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp18Q9WTV6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp18Q9WTV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms