Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms