Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slco1a1Q9QXZ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slco1a1Q9QXZ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1a1Q9QXZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1a1Q9QXZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1a1Q9QXZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco1a1Q9QXZ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco1a1Q9QXZ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1a1Q9QXZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms