Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI6

Ackr1, Atypical chemokine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ackr1Q9QUI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ackr1Q9QUI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ackr1Q9QUI6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ackr1Q9QUI6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ackr1Q9QUI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ackr1Q9QUI6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ackr1Q9QUI6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms