Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmub1Q9JMG3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmub1Q9JMG3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmub1Q9JMG3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmub1Q9JMG3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmub1Q9JMG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmub1Q9JMG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms