Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms