Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col5a3Q9JLI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col5a3Q9JLI2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col5a3Q9JLI2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col5a3Q9JLI2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col5a3Q9JLI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col5a3Q9JLI2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col5a3Q9JLI2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col5a3Q9JLI2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms