Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nectin3Q9JLB9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nectin3Q9JLB9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nectin3Q9JLB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nectin3Q9JLB9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms