Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ncoa6Q9JL19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ncoa6Q9JL19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ncoa6Q9JL19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ncoa6Q9JL19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ncoa6Q9JL19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ncoa6Q9JL19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms