Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmx1aQ9JKU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmx1aQ9JKU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmx1aQ9JKU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmx1aQ9JKU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmx1aQ9JKU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmx1aQ9JKU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmx1aQ9JKU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms