Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp39a1Q9JKJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp39a1Q9JKJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms