Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba8Q9JJZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba8Q9JJZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba8Q9JJZ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tuba8Q9JJZ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba8Q9JJZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms