Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd3Q9JJY3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd3Q9JJY3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd3Q9JJY3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd3Q9JJY3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd3Q9JJY3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms