Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip3Q9JJR9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrip3Q9JJR9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrip3Q9JJR9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrip3Q9JJR9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrip3Q9JJR9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms