Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms