Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr12Q9JJA4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr12Q9JJA4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr12Q9JJA4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr12Q9JJA4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr12Q9JJA4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr12Q9JJA4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms