Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ78

Pbk, Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbkQ9JJ78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PbkQ9JJ78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PbkQ9JJ78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PbkQ9JJ78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PbkQ9JJ78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PbkQ9JJ78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms