Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lmbr1Q9JIT0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmbr1Q9JIT0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmbr1Q9JIT0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmbr1Q9JIT0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1Q9JIT0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1Q9JIT0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms