Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tor1aQ9ER39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tor1aQ9ER39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1aQ9ER39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor1aQ9ER39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tor1aQ9ER39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tor1aQ9ER39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms