Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnal4Q9DCM4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnal4Q9DCM4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnal4Q9DCM4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal4Q9DCM4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnal4Q9DCM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms