Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apbb2Q9DBR4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb2Q9DBR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apbb2Q9DBR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apbb2Q9DBR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb2Q9DBR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms