Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp27a1Q9DBG1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp27a1Q9DBG1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp27a1Q9DBG1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp27a1Q9DBG1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp27a1Q9DBG1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms